Korpus je trebao objediniti jedinice Teritorijalne odbrane, kao i neke dobrovoljačke jedinice. Komandant je postao Enver Hadžihasanović.
U zonu odgovornosti Trećeg korpusa Armije RBiH trebale su ući sljedeće općine: Banja Luka, Bosanska Dubica, Bosanska Gradiška, Bugojno, Busovača, Čelinac, Donji Vakuf, Gornji Vakuf, Jajce, Kakanj, Kotor Varoš, Kupres, Laktaši, Mrkonjić Grad, Novi Travnik, Prnjavor, Skender Vakuf, Srbac, Šipovo, Travnik, Vitez, Zavidovići, Zenica i Žepče. Zbog borbi, zona odgovornosti je naknadno promijenjena i u nju je uključena općina Vareš, prenosi Historija.ba.
Štab 3. korpusa je bio u Zenici. Sastojao se od nekoliko centara i to:
1. Centar za operativno komandovanje koji je prikupljao informacije koje su pristizale od civilnih struktura, MUP-a.
2. Centar za vezu, imao je zadatak planiranje i organiziranje svih veza u sklopu Komande.
3. Služba vojne bezbjednosti obuhvatala je poslove kontrašpijunaže, vojne policije, fizičke zaštite objekata.
Jedinice 3. korpusa:
– Vojna policija 3. korpusa
1. Operativna grupa Bosanska Krajina
7. muslimanska brdska brigada
17. brigada
306. brigada, jedno vrijeme pripadala Operativnoj grupi Zapad
325. brigada
2. Operativna grupa Lašva
309. brigada
325. brigada
333. brigada
3. Operativna grupa Bosna
318. brigada
319. brigada
4. Operativna grupa Zapad
307. brigada
308. brigada
312. brigada
Operativna grupa 7-Jug-Maglaj
372. brigada garava Tešanj
373. motorizovana brigada Doboj
374. brigada Teslić
377. Pousorska ljuta brigada Jelah
Slijedeće brigade su primale naređenja direktno od Komande 3.koprusa
301. brigada
303. brdska brigada
314. brdska brigada
El Mudžahedin
